Summary Class notes - Immunology

Course
- Immunology
- -
- 2018 - 2019
- Vrije Universiteit Amsterdam
- Biomedische Wetenschappen
304 Flashcards & Notes
2 Students
  • These summaries

  • +380.000 other summaries

  • A unique study tool

  • A rehearsal system for this summary

  • Studycoaching with videos

Remember faster, study better. Scientifically proven.

Summary - Class notes - Immunology

  • 1559685600 Lecture 1

  • Why is the immune system important?
    To survive infections.
  • How do pathogens come into the body? Why via these tissues?
    Via mucosal tissues because these tissues are very permeable.
  • What are examples of mucosal tissues?
    • Respiratory tract
    • Urogenital tract
    • Gastrointestinal tract
  • What are two different classifications of pathogens?
    • Intracellular
    • Extracellular
  • What immune cells belong to the innate immune system?
    • Granulocytes (short life cycle)
    • Macrophage
    • Neutrophils
    • NK cells
    • Complement
  • What is the difference between granulocytes and macrophages?
    Granulocytes kill bacteria and macrophages 'eat' big particles.
  • What immune cells belong to the adaptive immune system?
    The lymphocytes:
    • B-cell (made in bone marrow)
    • T-cell (made in thymus) 
  • What does CD mean in CD4 and CD8?
    Cluster of deviation
  • When do you speak of a disturbed immune system?
    • Autoimmune diseases (against 'self')
    • Allergies

    These are both immune responses against harmless things.
  • What is so special about the immune system?
    The immune system is a balance between activation and inactivation (immunity vs tolerance).
  • How can you artificially induce immune responses?
    • Vaccination
    • Anti-tumor therapy
  • What is an epitope?
    An epitope is the exact part that is recognized by an immune cell.
  • What are the three levels of protection?
    1. Barriers: skin, mucous, membranes, chemicals
    2. Innate immune response: immediate response, fast, not specific
    3. Adaptive immune response: slow to be activated, very specific
  • What are the characteristics of the innate immune system?
    • Recognition of pathogens
    • Immediate, very fast
    • Occurs in tissues
    • Influx of immune cells
  • What are the characteristics of the adaptive immune system?
    • Memory
    • Slow to develop
    • Develops in lymphoid tissues
    • Generation of memory
    • Two parts: cellular + humoral
  • What are the features of inflammation and how is this mediated?
    Calor (heat), dolor (pain), rubor (redness), tumor (swelling). This is mediated by cytokines.
  • What is the difference between cytokines and chemokines?
    Cytokines are for cell division and activation, this occurs via autocrine and paracrine signalling. 
    Chemokines are for migration, this occurs via paracrine signalling.
  • What is the complement system? What immune system is the complement system part of?
    Complement is a protein that recognizes a pathogen (1) and serves as a flag for effector cells (2). The complement system is part of the innate immune system.
  • What is the pathway of the adaptive immune system?
    • Generation of a diverse repertoire of T and B cells each with a unique receptor (TCR and BCR)
    • Naive B and T lymphocytes
    • Specific clones proliferate after recognition clonal expansion
    • Effector lymphocytes elimination of pathogens
    • Memory lymphocytes
  • What happens after macrophages recognize pathogens?
    After macrophages recognize pathogens, cytokines signal to the bone marrow to release neutrophils (where they are stored).
  • What is the difference between primary and secondary lymphoid organs?
    Primary lymphoid organs are organs where lymphocytes and leukocytes are produced (bone marrow and thymus). Secondary lymphoid organs are lymph nodes, the spleen and GALT (peyer's patches) in the gut. These organs filter the lymph fluid and activate the adaptive immune system by pathogens.
  • When can the adaptive immune system go to the tissues?
    When it is activated sufficiently.
  • What are naive (B and T) cells?
    Naive cells have nog 'met' a pathogen yet. They can only find pathogens in the lymph nodes. When naive cells are activated, the effector cells that they have become go into the tissue.
  • What is the difference between afferent and efferent lymph vessels?
    Afferent lymph vessels go into the lymph node and efferent (e is for exit) lymph vessels go out of the lymph node.
  • How are the innate and adaptive immune system connected?
    Lymph fluid with pathogens and cells from the tissues are filtered in the lymph node. B cells in the lymph node recognize  intact antigens. Dendritic cells and macrophages phagocytose pathogen. DC and MQ are antigen presenting cells (APCs). DC process pathogens to fragments and present those to T cells in the draining lymph node.
  • What is the advantage of memory response?
    1. Faster
    2. Stronger (more B cells)
    3. Better (higher affinity (B cells))
  • What are the two types of T cells?
    • Killer T cell: Cytotoxic T cell (CTL): CD8 marker
    • Helper T cell: CD4 marker
  • What are the two ways antibodies prevent infection?
    • Binding to it to kill the cell
    • Promoting uptake to kill the cell
  • Where are B cells generated? Where T cells?
    B cells: bone marrow
    T cells: thymus
  • What do B cells recognize? What about T cells?
    B cells: intact antigen
    T cells: processed antigen, presented by APC
  • What is the difference in response of B and T cells?
    B cells: humoral response (antibodies)
    T cells: cellular response (CTL and Th cells)
Read the full summary
This summary. +380.000 other summaries. A unique study tool. A rehearsal system for this summary. Studycoaching with videos.

Summary - Class notes - Immunology

  • 1483138800 Wstęp

  • Spis używanych skrótów:
    Ab - antibody - przeciwciało
    ADCC - Antibody-Dependent Cell Cytotoxicity - cytotoksyczność komórkowa zależna od przeciwciał
    APC - antigen presenting cell - komórka prezentująca antygen
    BCR - B cell receptor - receptor limfocytów B
    CD - cluster of differentiation - antygen różnicowania komórkowego
    GM-CSF - granulocyte macrophage colony-stimulating factor - czynnik stymulujący tworzenie kolonii granulocytów i makrofagów
    HLA - human leukocyte antigen - główny układ zgodności tkankowej człowieka
    IFN - interferon - interferon
    IL - interleukine - interleukina
    ITAM - immunoreceptor tyrosine-based activation motif - motyw aktywacji immunoreceptora tyrozyny
    MAPK - mitogen activated protein kinases - kinazy białkowe aktywowane przez mitogen
    MHC - major histocompatibility complex - główny układ zgodności tkankowej
    NK - natural killer - natural killer
    SCF - stem cell factor - czynnik komórek macierzystych
    TCR - T cell receptor - receptor limfocytów T
    TGF - transforming growth factor - transformujący czynnik wzrostu
    TNF - tumour necrosis factor - czynnik martwicy nowotworu
    VEGF - vascular endothelial growth factor - czynnik wzrostu śródbłonka naczyniowego
  • Moje notatki pochodzą
    • z książek:
    "Immunologia" - Gołąb, Jakóbisiak
    "Immunologia" - Riott, Brodstoff, Male
    "Krótkie wykłady. Immunologia." - Lydyard, Whelan, Fanger
    •   z kursów on-line:
    "Immunology" by Khan Academy
    "Introduction to the Biology of Cancer" by Johns Hopkins University
    "Introduction to Breast Cancer" by Yale University
    "Immunology" by Armando Hasudungan

    JK
  • 1483225200 Wprowadzenie do układu odpornościowego

  • W skład układu odpornościowego wchodzą:
    a) komórki:
    • limfocyty B
    • limfocyty T
    • fagocyty  (kom. żerne)
    b) cząsteczki
    • immunoglobuliny
    • receptory limfocytów T wiążące antygen
  • Rola poszczególnych komórek układu odpornościowego:
    Limfocyty B - rozpoznają antygeny i wytwarzają przeciwciała (CD19, CD20)
    Plazmocyty - wytwarzają przeciwciała
    Limfocyty Th - wspomagają odpowiedz immunologiczna; wydzielają cytokiny (CD4, CD2, CD3)
    Limfocyty Treg - hamują odpowiedz immunologiczna; wydzielają cytokiny  (CD2, CD3)
    Limfocyty Tc - zdolne do zabicia komórek docelowych (CD2, CD3, CD8)
    Komorki K - zdolne do cytotoksyczności komórkowej zależnej od przeciwciał
    Komorki NK - zdolne do spontanicznego zabicia komórek nowotworowych i zakażonych przez wirusy
    Komorki dendrytyczne - prezentują antygeny limfoctyom T; wydzielają cytokiny
    Monocyty, makrofagi - zdolne do fagocytozy i zabicia mikroorganizmów oraz innych obcych komórek; wydzielają cytokiny
    Neutrofile - zdolne do fagocytozy i zabicia mikroorganizmów
    Komorki tuczne, bazofile - uczesniczą w odpowiedzi przeciwpasozytniczej, wydzielają mediatory prozapalne, uczestniczą w nadwrazliwości typu I
    Eozynofile - zdolne do fagocytozy i zabicia niektórych pasozytów z udzialem przeciwciał
    Megakariocyty - wytwarzają trombocyty uczestniczące w krzepnieciu krwi i reakcjach zapalnych
    Erytrocyty - poprzez receptor dla dopelniacza wiążą kompleksy immunologiczne i uczestniczą w ich usuwaniu
  • Które komórki rozpoznają antygeny i wytwarzają przeciwciała?
    Limfocyty B
  • Które komórki są zdolne do zabicia komórek docelowych?
    Limfocyty T cytotoksyczne
  • Przyporządkuj receptory do odpowiednich grup komórek:
    • Limfocyty T pomocnicze (Th), Limfocyty T cytotoksyczne (Tc)
    • CD2, CD3, CD4, CD8
    Limfocyty Th - CD2, CD3, CD4
    Limfocyty Tc - CD2, CD3, CD8
  • Istnieją dwa typy odpowiedzi immunologicznej:
    1. typu komórkowego - w miejscu wniknięcia antygenu gromadzą się komórki (głównie limfocyty, makrofagi i granulocyty), uwalniane są cytokiny, co powoduje zabicie komórek docelowych -> rola limf. Th1
    2. typu humoralnego - wytwarzanie i uwalnianie do środowiska przeciwciał przez limfocyty B i plazmocyty -> rola limf. Th2
  • Który typ odpowiedzi immunologicznej jest związany z wytwarzaniem przeciwciał?
    Typ humoralny
  • Cechy antygenów:
    immunogenność - zdolność do wywoływania przeciw sobie swoistej odpowiedzi immunologicznej
    antygenowość - zdolność do swoistego łączenia się z immunoglobulinami i receptorami limfocytow T
  • Połącz pojęcia z odpowiednią definicją.
    1. ANTYGENOWOŚĆ,
    2. HAPTENY,
    3. IMMUNOGENNOŚĆ
    a. zdolność do wywoływania przeciw sobie swoistej odpowiedzi immunologicznej
    b. zdolność do swoistego łączenia sie z immunoglobulinami i receptorami limf. T
    c. związki wykazujące tylko antygenowość, a zyskujące immunogenność po połączeniu z nośnikiem
    1. b
    2. c
    3. a
  • Znajdź synonimy do mechanizmów SWOISTYCH i NIESWOISTYCH. 
    (specyficzne, innate, skierowane przeciwko konkretnemu "przeciwnikowi", nabyte, wrodzone, niespecyficzne, pierwsza linia obrony, adaptive)
    Mechanizmy swoiste = specyficzne = nabyte = adaptive = skierowane przeciwko konkretnemu "przeciwnikowi"
    Mechanizmy nieswoiste = niespecyficzne = wrodzone = innate = pierwsza linia obrony
  • Odporność  wrodzona:
    • szybka odpowiedź - komórki żerne: leukocyty, wielojądrzaste i makrofagi -> cytokiny
    • pewne cechy specyficzności - komórki NK -> dopełniacz
    • brak pamięci - komórki tuczne, komórki dendrytyczne -> białka fazy ostrej


    Odporność nabyta:
    • zapoczątkowanie odpowiedzi wymaga dłuższego czasu - limfocyty T i B -> przeciwciała
    • duża specyficzność -> cytokiny
    • pamięć
  • Rola limfocytów Th w odporności komórkowej.
  • 1483311600 Przeciwciała

  • Przeciwciała składają się z:
    a) jednego z dwóch typów lancuchów lekkich:
    • κ (kappa)
    • λ (lambda)

    b) jednego z pięciu typów łańcuchów ciężkich (co warunkuje ich klasę):
    • α (alfa) -> IgA  [znajdują się w pocie, łzach, wydzielinach układu pokarmowego]  DIMERY
    • δ (delta) -> IgD
    • ε (epsilon) -> IgE   [pasożyty, alergie - nadwrażliwość typu I]
    • γ (gamma) -> IgG  [przechodzą przez łożysko; zabijają mikroorganizmy w tkankach]
    • μ (mi) -> IgM  [aktywują dopełniacz; syntetyzowane jako pierwsze przez dziecko]  PENTAMERY
  • Które przeciwciała znajdują się w pocie, łzach i wydzielinach układu pokarmowego?
    Przeciwciała klasy A
  • Zmienność przeciwciał (liczba w nawiasie mówi o liczbie kombinacji):
    Łańcuch ciężki składa się z części V(51)  D(27)  J(6)  -> liczba kombinacji 8262
    Łańcuch lekki składa się z części V(40)  J(5)  -> liczba kombinacji 200
    Stąd liczba możliwych przeciwciał: 1 652 400!!!
  • Za wycinanie odpowiednich genów odpowiadają białka aktywujące rekombinacje o aktywności endonukleaz RAG-1 i RAG-2. Odpowiadają one za rozpoznanie sekwencji sygnałowych i pojawienie się nacięć w obydwu niciach DNA.
  • Za doczepianie nukleotydów na złączach V/D i D/J odpowiada transferaza nukleotydów końcowych TdT. Regiony te składają się głównie z cytozyny i guaniny.
  • Przyporządkuj definicje:
    1. RAG-1 & RAG-2 
    2. TdT
    a. geny aktywujace rekombinacje o aktywności endonukleaz
    b. enzym odpowiedzialny za dolaczanie nukleotydow na zlaczach V/D i D/J
    1. a
    2. b
  • Przeciwciała monoklonalne powstają z jednego klona limfocytów B po fuzji z komórkami szpiczaka.
  • Powstawanie przeciwciał monoklonalnych:
    1. Immunizacja zwierzęcia antygenem, na który chcemy otrzymać przeciwciała.
    2. Pobranie limfocytów śledziony (są w stanie przeżyć w podłożu selekcyjnym HAT)
    3. Mamy tez komórki szpiczaka (o zaburzonej produkcji przeciwciał)
    4. Fuzja obu typów komórek w obecności glikoproteiny lub glikolu polietylenowego (stymulującego fuzje)
    5. Hodowla w podłożu HAT przez 1-2 tygodni. Po tym czasie komórki szpiczaka umrą z powodu blokerów biosyntezy zasad azotowych zawartych w podłożu, a limfocyty śledziony, które nie uległy fuzji ulegną apoptozie.
    6. Wybór konkretnych populacji komórek hybrydowych o określonej swoistości.
    7. Hodowanie każdego klona w osobnym naczyniu hodowlanym.
    8. Uzyskanie przeciwciał monoklonalnych (mAb).
  • Typy przeciwciał:
    • ludzkie - od człowieka
    • mysie - od myszy
    • chimeryczne - ludzkie z mysią częścią zmienną
    • humanizowane  - ludzkie z mysimi CDR
  • Przeciwciała antyidiotypowe - przeciwciała skierowane przeciwko determinantom we fragmencie Fab innego przeciwciała
    • spełniają one ważne funkcje regulatorowe
    • mogą hamować lub stymulować odpowiedz immunologiczna
    • mogą naśladować antygeny nowotworowe, stymulując odpowiedz immunologiczna
Read the full summary
This summary. +380.000 other summaries. A unique study tool. A rehearsal system for this summary. Studycoaching with videos.

Latest added flashcards

What is the function of SCFA?
SCFA is produced in the gut and leads to a lower insulin sensitivity and lower fat accumulation in adipose tissue. GPR43 in the adipose tissue is then activated and leads to higher insulin sensitivity in the muscle and liver.
What is clostridium difficile?
The fact that antibiotic treatment can promote infection with resistant bacteria is called clostridium difficile.
What are commensal bacteria-mediated mechanisms of protection against intestinal pathogens?
  • Commensal bacteria communities consume nutrients and energy sources, depriving pathogens of a niche
  • Microbiota-derived metabolic by-products directly inhibit pathogens
  • Commensal bacteria stimulate immune cells and drive basal expression of host defense factors
What are positive functions of the bacterial microflora in the intestines?
  • Synthesize essential metabolites (vitamins)
  • Break down plant fibers in food
  • Inactivate toxic substances in food or made by pathogens
  • Prevent pathogens from benefitting from the resources of the human gut
  • Interact with epithelium to trigger development of secondary lymphoid tissue
What is meant with oral tolerance?
  • Conditioning of DC by factors in the intestines
  • Deletion of antigen specific T cells by tolerating DCs
  • Induction of antigen-specific regulatory T cells which suppress antigen-specific T cells
This all leads to a suppression of the immune system instead of activation.
What is the difference between mucosal and peripheral immune responses?
Mucosal immune responses have not a huge inflammatory action.
What is the most important function of IgA?
Neutralization
To what receptor does IgA bind?
Poly-Ig receptor
What are intraepithelial lymphocytes?
Intraepithelial lymphocytes are located in the epithelium layer. The receptor is in the lumen and can detect antigens.
What are effector mechanisms of the mucosal immune system?
  • Activated effector T cells predominate even in the absence of infection
  • Plasma cells are in the tissues where antibodies are needed