Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van DNA damage, repair and mutations

• 1 Introductie Tekst

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1
  Laat hier meer flashcards zien

• Waar start de DNA-replicatie en wanneer?

  Bij de origins of replication tijdens de S-fase van de cel cyclus

• Hoe vergaat DNA-replicatie? Van welke kant kunnen DNA-polymerases nieuwe nucleotiden inbouwen?

  In het algemeen van links en rechts, bidirectioneel vanaf de origin of replication. De polymerases hebben een vrije 3'-eind nodig om de polymerisatie te starten. Een primase synthetiseert een RNA primer waarna de DNA polymerases verder kunnen met hun werk.

• Hoevaak wordt door DNA polymerase een verkeerd nucleotide ingebouwd?

  1 in de 10.000 keer

• Wat gebeurt er na de proofreading om het aantal gemaakte incorporatie fouten nog meer te verminderen.

  MMR (mismatch repair) doet een poging de fouten te herstellen veroorzaakt door degradatie van de nieuw gesynthetiseerde DNA streng en door het exonuclease zelf.

• 4 DNA schade en de gevolgen

• Geef voorbeelden van endogene alterations aan het DNA die schade veroorzaken?

  Intrinsieke instabiliteit tussen de chemische bonds (deaminatie, depuratie, dehydrolyse)

  Door interactie met endogene reactieve moleculen in de cel die zorgen voor oxidatie en methylatie van DNA-basen.

  Een vaak voorkomende vorm van DNA beschadiging is depurinatie en depyrimidinatie van basen die resultern in  apurinic or apyrimidinic sites (AP sites) die hun base hebben verloren.

• Wat zijn de gevolgen van ioniserende stralen op DNA?

  Het zorgt voor single and double stranded breaks, apurinic sites en modified DNA bases.

  De meestgevormde DNA laesies door UV licht zijn cyclobutane pyrimidine dimers (CPD) en 6-4 fotoproducts door het covalente linken van naburige pyrimidines.

• Wat zijn bulky DNA adducts?

  bvb. UV fotoproducten. Ze verstoren de vorm van de DNA helix, deze zal de capaciteit verliezen de basen correct te paren.

• Wat doen chemical agents?

  Ze reageren direct met DNA of hebben eerst metabolische activatie nodig om een DNA-beschadigende metaboliet te verwerven. Chemical agents kunnen allerlei DNA adducten veroorzaken van 'kleine' gemethyleerde basen tot bulky lesions--> helical distortions

• What gebeurt er als kleine alkyl groepen worden toegevoegd aan de DNA bases?

  Zoals methyl en guanine aan de O6 positie--> alter base pairing properties--> mispairing during replication.

• Geef voorbeelden van poly-functional agents en leg uit wat ze doen

  Vb: cisplatine en mitomycine C

  Ze hebben meer dan een reactive site die reageert met DNA--> mono- adducts wanneer één van de actieve groep reageert met DNA en crosslinks wanneer beide groepen reageerden met DNA.