Samenvatting Essential Cell Biology, Fourth Edition

-
ISBN-10 1317806271 ISBN-13 9781317806271
155 Flashcards en notities
58 Studenten
  • Deze samenvatting

  • +380.000 andere samenvattingen

  • Een unieke studietool

  • Een oefentool voor deze samenvatting

  • Studiecoaching met filmpjes

Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.

Dit is de samenvatting van het boek "Essential Cell Biology, Fourth Edition". De auteur(s) van het boek is/zijn Bruce Alberts Dennis Bray Karen Hopkin Alexander Johnson Julian Lewis Martin Raff Keith Roberts Peter Walter. Het ISBN van dit boek is 9781317806271 of 1317806271. Deze samenvatting is geschreven door studenten die effectief studeren met de studietool van Study Smart With Chris.

PREMIUM samenvattingen zijn gecontroleerd op kwaliteit en speciaal geselecteerd om je leerdoelen nog sneller te kunnen bereiken!

Samenvatting - Essential Cell Biology, Fourth Edition

  • 0 Presntatie

  • Dia 1:
    1. Wij zijn LMN
    2. Onze presentatie gaat over de werking van THC.
    Dia 2:
    1. Cannabis is een plant waarvan delen worden gebruikt als soft drugs.
    2. Wanneer cannabis gebruikt wordt, kan de gebruiker zich sloom, zwaar en high voelen.
    3. De gebruiker voelt zich ontspannen en minder geremd. Ook slaperigheid, misselijkheid, duizeligheid zijn effecten.
    4. Een populair effect van het gebruik van cannabis is de vreetkick (‘the munchies’).
    5. In onze presentatie gaan wij behandelen hoe het komt dat de gebruiker deze vreetkick krijgt.
    6. De werkzame stof in Cannabis heeft ook effect op andere signaaltransductie routes, deze zullen wij ook kort behandelen.

    Dia 4:
    1. Tetrahydrocannabinol (THC) is de werkzame stof in cannabis, de structuurformule is weergegeven op het bord.
    2. THC is een agonist van de neurotransmitter anandamide, ook deze structuurformule is weergegeven op het bord.

    Dia 5:

    1. Een receptor is specifiek, dit betekent dat er maar enkele stoffen op de receptor kan binden. Zoals de receptor van anandamide.
    2. Echter bestaan er moleculen die ook aan deze receptoren kunnen binden, dit zijn moleculen die overeenkomsten hebben met de liganden van de receptoren. Deze moleculen heten agonisten en antagonisten.
    3. Een agonist kan aan dezelfde receptor binden en zodoende ook een signaal afgeven, terwijl een antagonist alleen aan de receptor kan binden maar verder geen invloed op signaaltransductie heeft.
  • Dia 11:
    1. Verder heeft de THC ook invloed op andere signaleringsroutes in de cel.
    2. De bindingvan THC (of een andere cannabinoid) aan CB1 zorgt voor inhibitie van adenylyl cyclase.
    3. Het adenylyl cyclasepathway is weergegeven in de figuur op het bord.

    Dia 12:

    1. Als adenylyl cyclasewordt geactiveerd, zet deze ATP om in cAMP. cAMP activeert PKA.
    2. Dit PKA kan op zijn beurt weer andere enzymen fosforyleren/activeren.
    3. Deze route is bijvoorbeeld belangrijk bij de signaleringsroute van adrenaline.
    4. Wanneer adenylyl cyclase onderdrukt wordt, kan deze signaaltransductie route niet plaatsvinden.

    1. De binding van THC (of een andere cannabinoid) aan CB1 zorgt voor activatie van het IP3 pathway.
    2. Het G-eiwit activeert hierbij Phospholipase C. Dit membraangebonden enzym knipt van inositol phospholipid de inositol triphosphate groep (IP3) eraf.
    3. Hierdoor blijft het phospholipid deel in het celmembraan zitten en IP3 zich in het cytosol begeeft.
    4. Het IP3 beweegt zich naar het dubbelmembraan van het ER en opent hier de calciumkanalen.
    5. Calciumconcentratie is laag in het cytosol en hoog binnen het ER, hierdoor komt calcium de cel in.
    6. De toenemende concentratie van calcium in het cytosol zorgt ervoor dat wanneer er een influx van calcium nodig is, om bijv. een signaal door te geven, dit niet gebeurt.
    7. Als de calciumkanalen in het plasmamembraanopengaan, is het potentiaalverschil niet groot genoeg om calcium de cel in te diffunderen. Zodoende kan het zijn dat een signaal niet wordt doorgegeven.
  • 1 Titel

  • laksjaslkjaslkjalkjsdflk

  • wat is een gen
    een coderend stukje DNA
  • fsdl;kfsd;lfsdl;fk

  • 7 DNA tot eiwit: Hoe de cel leest de genoom

  • Benoem twee chemische verschillen van RNA met DNA?
    • Suiker ribose
    • Uracil (U) ipv Thymine (T)
  • Benoem structurele verschillen van RNA met DNA?
    Enkelsteng - vorm -> functie -> katalyse  
  • Welke enzym zorgt voor de RNA transcriptie?
    RNA -polymerase:
    • katalyse  fosfodiester bondings
    • Vorming suikerfosfaat backbone
  • Wat maakt RNA-polymerase op de DNA strand om te stoppen?
    Volgorde van nucleotiden.
    Aan de promotor zit een volgorde die wijst voor het starten 
    Voor bacterieen is Sigma-factor
  • Hoe nauwkeurig is RNA-polymerase tegen DNA-polymerase?
    10^4 vs 10^7
  • Ongeacht gleijkenis RNAP en DNAP, wat zijn verschillen?
    • RNAP - katalyseerd ribonucleotiden, geen deoxyribonucleotiden
    • RNAP - anders dan DNAP geen primer nodig voor streng te starten.
    Fouten zijn togestaan dus RNA is geen opslagruimte GI
  • Welke tippen RNA zijn bekend?
    • mRNA- instructie dragers
    • rRNA - componenten van ribosomen
    • tRNA - Adapter tijdens eiwit synthese
  • Wat is het verschil tussen PK en EU in transcriptie?
    • PK - DNA in cytosplasm met ribosomen waar eiwit synthese gebeurt
    • EU - DNA in de kernen (transcriptie) maar eiwit in de ribosomen die in cytoplasma staan ->steps van maken verschillende RNA
  • Wat wordt gemaakt door "capping and polyadenylation"
    mRNA
    • Hoger stabiliteit
    • Eiwit herkent een complete boodschaap
  • Wat gebeurt met de RNA strand na de capping?
    RNAP - transcribeerd gen -> Splicing -> (intron verwijderd) exonen samen gestikt.
    Splicing door snRNP's (die bindt een eiwit ervoor) - maket het kern ervan
  • Bij transcriptie van EU DNA welke delen worden door gegeven?
    EU gen in DNA bestaat uit intronnen en exonnen, beide wordt transcribbed
  • Wat gebeurt met de RNA strand na de capping?
    RNAP - transcribeerd gen -> Splicing -> (intron verwijderd) exonen samen gestikt.->Poly A -> (gemodificeerd 5'-3') functioneel mRNA Splicing door snRNP's (die bindt een eiwit ervoor) - makt het kern ervan
  • Wat gebeurt met de RNA strand na de capping?
    RNAP - transcribeerd gen -> Splicing -> (intron verwijderd) exonen samen gestikt.
    Splicing door snRNP's (die bindt een eiwit ervoor) - maket het kern ervan
  • DNA codering alfabet?
    Een volgorde van 4 nucleotiden 1950
  • Hoe wordt een eiwit gevormd?
    De volgorde van 20 aminozuren die bepalen hoe te vouwen vandaar functioneren 
  • Hoe wordt informatie van DNA doorgegeven?
    Eerst van DNA naar een ander nucleïnezuur RNA. Gen uit DNA segment bepaald hoe een eiwit moet gesynthetiseerd worden.
  • RNA splicing?
    Een manier bij EU waarop segmenten van RNA transcript wordt verwijderd en terug ingenaaid. VOOR synthese van eiwit. 
  • Wat is samen met transcriptie en translatie?
    Manier waarop cellen worden gelezen en expressen de instructies uit gennen
  • Wat is de eerste proces van expressie?
    Dit is kopiëren van de gen nucleotiden volgorde op RNA - transcriptie
  • RNA?
    Lineaire volgorde van nucleotiden samengesteld mbh fosfodiësterbindingen. 
  • Waaraan lijkt transcriptie?
    Transcriptie maakt een RNA die  aan de DNA coderende streng lijkt
    • Tempalte -> Nucleotiden (groeiende keten) -> koppeling -> Covalent gebonden aan RNA strand door  RNAP. 
    • De RNA transcript is complementair aan template of gelijk aan de coderende  streng
  • Wat zijn verschillen van transcriptie uit DNA replicatie?
    • RNA streng - blijft niet waterstof gebonden ipv blijft achter de toegevoegde ribonucleotiden
    • RNA verplaatst, DNA hervormt. Daarom RNA is enkel streng
    • RNA kopieert -> korter enkel duizend NP tv DNA 250 miljoen
  • Beschrijf RNAP
    Door RNAP wordt  fosfodietser bondings katalyseerd dat bindt nucleotiden samen hetzij  vormt suiker fosfaatskelet 
    1. RNAP loopt langs DNA afwikkelend voor complementair BP. 5->3 richting een nucleotide per tijd
    2. Komend ribonucleoside triofosfaten (ATP, CTP, UTP, GTP) voorzien energie
    3. De heel snele vrijuitkomen geeft aan dat uit hetzelfde gen komen, dus de volgende RNA begint voordat de eerste klaar is
     
  • Wat specificeert aminozuur volgorde in eiwitten?
    Gen in DNA
  • Wat is de gen expressie?
    Een proces waarbij de informatie gecodeerd in DNA is vertaald in een product dat invloed heeft aan de cel  of organisme
    • Als eind product een eiwit is, omvat GE transcriptie en translatie (vertaling)
    • Als een RNA is eind product van een gen, hoeft er geen translatie plaats te vinden
  • Wat is een mRNA?
    Een RNA molecuul gecodeerde door een gen die eiwit synthese rechtstreeks
    • EU - elke uit een gen dat codeert voor enkel eiwit
    • PK - Set van multiple genen coderen een mRNA, dus draagt informatie voor paar eiwitten
    • Eind product is RNA die structurele regelgeving, katalytisch componenten van cel zijn
  • Wat is de rol van bepaalde RNA?
    • mRNA - codeert voor eiwitten
    • rRNA - Maakt de kern van ribosom structure, katalyseerd eiwit synthese
    • miRNA - Regulatie van genexpressie
    • tRNA - adoptoren tussen mRNA en aminozuren (eiwit synthese) 
    • De rest
  • Wat gebeurt als RNAP botst met DNA?
    • Bacteriën - herkenningsplaats wordt bepaald "promotor" - direct stroom op specifieke volgorde van NC
    • Gevonden ->gebonden ->openen->Klein stukjes DNA
    • Een DNA is template BP wit complientair BP trifosftaen 
    • Twee ervan TF gebonden RNAP om te syntheseren
    • Streng verlengen totdat stopcodon komt
  • Welke streng is template?
    Kijk naar onderstreept, wegens polariteit van promotor kan alleen 3->5 richting gekozen worden (in gegeven voorbeeld)
    • DE ORIENTATIE VAN PROMOTOR bepaald welke richting moet en welke streng template moet zijn
  • Wat zijn verschillen in de RNAP en initiatie transcriptie factoor PK en EU?
    1. EU :
      • RNAP I - transcribeerd tRNA, rRNA ander (katalyse etc)
      • RNAP II - miRNA
      • RNAP III - tanscribeerd tRNA, rRNA ander (katalyse etc)   
      • Bacteriën hebben iv en v nog 
      • Met Sigma factor alles kan zelf doen EU de hele machinerie hoef hebben
    2. PK: 
    3.  Initiatie transcriptie factor complex, groot afstnd tussen NP voor EU, kleine voor PK
    4.  EU compact verpakking  DNA (nucleosoom)
  • Wat is noodzakelijke voor RNAP om te starten?
    • TATA box hebt nodig TFIID = TFB te binden
    • TFIID laat TFIIB te binden
    • De rest met de RNAP bindt aan promotor
    • TFIIH aandeel dubbel helix uit elkaar op start punt (ATP)
    • TFIIH ook fosforyleert RNAP vrij maken uit TF
    • De kant van fosforylatie is lange polypeptide keten staart streekt uit RNAP 
  • Wat maakt transcriptie initiatie complex?
    • TBP is subunit  uit TFIID bindt dat treekt andere TF dat ales vormt TIC
  • Hoe en met wat wordt RNAP vrijgemaakt?
    • TFIIH dat een PROTEIN KINASE hebt
    • Als transcriptie begon, wordt alle TF vrij (niet meer nodig)
    • Als RNAP is klaar met transcriptie van een gen, heeft het fostfaat groep op zijn start die met fosfatase wordt verwijdeert 
  • Is de eiwit synthese hetzelfde in bacterie en EU?
    • Nee, DNA templating wel om RNA te maken wel maar eiwit niet
    • Bacteriel direct naar de cytoplasma ->ribosomen->aan de 5' eind
    • EU->mRNA->capping, splicing, polyadenilatiie->cytosol deze processen gebeurt meteen na de afsnijden van gefosforyleerd staart tijden RNA synthese uit RNAP
  • Wanneer gebeurt capping en polyadenilatie?
    Als de eind product mRNA is
  • Hoe gebeurt capping en polyadenilatie?
    • Capping - Na de maken van 25 NC door RNAP voor het eind transcriptie wordt G gemetyleerd aan 5'
    • Polyadenylatie - Specifieke 3' waardoor:
    1. PK - RNA transcriptie beendigt
    2. EU - Een enzym verwijdert op een bijzonder volgorde
                    - Tweede enzym bindt poly-A start (circa 100 NC)
  • Wat zijn intronen en exonen, waar bevinden ze zich?
    • Intronen - noncodering geddelte alleen EU
    • exonen - codering volgorde NC - expressed volgorde 

    Aan het eind van intronen staat klein stukjes exonen die worden verwijderd in vorm van lasso
  • Hoe worden exonen bepaald?
    Door de volgorde NC
  • Wat is bijzonder met splicing vm andere stappen?
    • Splicing gebeurt afzonderlijk door RNA en niet door de eiwitten (snRNA)
    De snRNA maakt deel van kern van SPLICOSOMEN
    • Splicing vergroot codering potentiaal van menselijke genoom 
    • Niewue eiwiten wordt gecreeert door mixing en matching exons
    • U1....zijn snRNP's ->U1-5', U2-3"  ->Compl.BP- >eiwit interactie
    • Omlegging BP snRNP's en RNA transcript leidt splicosome exons te vinden en snijden
  • Hoe en wat zorgt voor een correcte transport uit pre-mRNA en mess om naar cytosol rijpe mRNA te transporteren?
    • Kern poriën
    • poriën maakt verbinding met nucleoplasm uit cytosol en selectief transporteert.
    • Set van eiwitten bepalen,  poly-A gebondend EW, cap-binding complex en mRNA gebondend EWeen deel wordt getransporteerd, hergebruikt (NC), verwijderd
  • Wat gebeurt met mRNA's in de cytosol?
    • EU - 30min - 10 uur gedrageerd door ribonucleases in NC 
    • Bacteriele - 3 min
    • Respons aan het signaal bepaalend, verzorgt door ribonucleases, gebeurt in 3' niet-vertallde regio van RNA (tussen 3' en poly-A) - control over EW secretie
  • Hoe komt introns in EU maar niet in PK?
    Hetzelfde voorouder van polymerase,  verschillende RNA splicing ; zijn er twee beweringen:
    • Een gen meerdere EW, door exon m-m nieuwe gennen evolueren -> grotere genoom , grotere RNA functie. PK - door evolutie sneller te vermenigvuldigingen hebben verliest
    • Door mobiele parasiet genetisch elementen de EU DNA binnengevallen
  • Door wijze van wat DNA->RNA->aminozuur volgorde in een eiwit wordt doorgegeven?
    • Nucelotide volgorde in aminozuur volgorde door genetische code. (Behalve mitochondira eigen)
    • Een mRNA heeft 3 NC codon,
    • Rischting van codons zijn met 5' naar de links? 
    • 1961  = 4x4x4 = 64 mogelijk combinaties
  • Hoe werd genetische code gevonden?
    • Door de cracken van mRNA peptideketen mede scheiding in centrifuge
    • Wederopbouw door ribonuclease en fosforylase 
    • Gebruik van poly-U(F), poly-A(K), ploy-C (P) keten
    • Volgende stap poly start te gebruiken
    • Uiteindelijk uitvinding dat drie NC lengte was (dus ribosoom en tRNA ook moet specifiek zijn )
  • Leg uit de werking en structuur van tRNA?
    • Een set van kleine RNA moleculen - transfer RNA's bindt mRNA met AZ
    • Kan verschillend zijn de grote (80 NC lang) en matching
    • 3D vorm, kan terug ontvouwen tot dubbel helix te vormen
    • Een regio vormt geen H-bonds- crucial voor functie
    • De anticodon regio bindt mRNA
    • Aan de 3' bindt AZ
    • Een rRNA kan match meerdere AZ
Lees volledige samenvatting
Deze samenvatting. +380.000 andere samenvattingen. Een unieke studietool. Een oefentool voor deze samenvatting. Studiecoaching met filmpjes.

Laatst toegevoegde flashcards

Wat is het centrale dogma?
Van DNA wordt met transcriptie RNA gemaakt en van RNA wordt vervolgens met translatie een eiwit gemaakt.
Welk van DNA, RNA of EW kan originele molecuul  bouwen?
RNA
Benoem post translationale modificatie van EW verder uit ribosomen?
Fosfolyratie - een manier, er zijn meerdere maar het meest belangrijke is initiatie van transcriptie  tijdens gen expressie
Wat proteolysis?
  • Gecontroleerd afbraak van EW door enzym tot AZ
  • Reden: Afbraken die kort-loevend zijn of misvouwen zijn
  • EU - proteasomen - cilinder selectoef kiezen (ATP)
  • Korte en zieke zijn geubiquitinzeerd door een enzym
  • Ubiquitin- een kleine EW wordt  (covalent) getagt EW-ten 
Hoe werken AB?
  • RNA en ew synthese  hogere dose maakt dood PK niet EU
  • Antbiotics komen uit fungi die door evolutie immune gecreëerd.
  • Fungi en bacterie dezelfde omgeving, terwijl fungi EU
  • Fungi immuniteit producten kan mens gebruiken
Wat zijn polysomen?
  • Meerdere RS binden nieuwe EW-n
  • Polysomen horen bij PK en EU
  • Bij PK sneller voor de transcriptie klaar is
Hoe wordt EW synthese begint PK?
  • Geen 5' cap ipv ribosoom-binding volgorde (tot 6 NC) boven AUG
  • RS - bindt in de binnenste mRNA - polycistronic (encode voor meerdere EW)
  • Stop codons UAA, UAG, UGA tRNA herkent niet - signal aan RS om te stoppen
  • Eiwit (release factor) bindt aan codon die in A kant zit dit geeft peptidyl transferase om water te produceren 
  • OH is vrijgemaakt - > mRNA gedissocieerd
  • Nieuwe EW ontmoetten chaperons.  
Hoe wordt EW synthese begint EU?
  • Vertalen van mRNA op codon AUG . geladen tRNA (altijd methionine, formyl-methionine bacteria) op N-terminus dus eind ew synthese eerst
  • Methionine verwijderd door protease
  • EU - wordt aan de P site van ribosoom waar intiatie-transcriptie factoren zetten (eiwitten). 
  • RS zoekt AUG 5'-3' , gevonden AUG dissociatie TF, volgende additie via tRNA aan A.
  • EU dragt signaal voor de particulaire ew
Wat is het verschil tussen  ribsoom en ribozym?
  • RS - meest complex 2/3 RNA 1/3 EW (mass) rRNA zijn verantwoordelijk voor zijn  structuur
  • RS - compact, 3D, op de operavlakte staan te vullen gevouwen RNA's
  • RS fucntie is te vouwen en vorm creëren voor RNA
  • 23S rRNA - kant spelt katalytisch functie voor PP keten - peptedyl transfrase - dit heet ribozyme
Waar wordt uitgevoerd translatie in EW?
  • In ribosomen waar rRNA (complex) wordt gevormd.
  • PK=EU, Kl. subunit bindt tRNA codon met mRNA. Gr. -katalyiseert PP